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http://www.scigress.com/
http://www.fqs.pl/en/chemistry/products/scigress简介 Scigress Explorer (CAChe)是用于生命科学、材料和化学的计算机辅助化学建模软件包，适用于实验化学家，生物化学家，药物化学家，计算化学研究者，以及高等教育工作者。Scigress Explorer (Cache)使用经典和量子力学方法，并有DGauss的图形界面，可以使用密度泛函理论进行计算。它包含很多新的半经验方法，可以计算直到20,000个原子的分子，甚至可以挑战实验精度。Scigress Explorer (CAChe)包含BioMedCAChe的所有蛋白质分析工具以及全部量子化学计算程序（Fujitsu MOPAC 2006 2002，Zindo，EHT，DGauss，Gaussian接口）的功能。 Scigress Explorer (CAChe)在7.7.0版以后，与Materials Explorer一起并入到SCIGRESS中。
功能 1. 药物设计。在几分钟内预测分子的活性，结构，和ADME性质；添加结构；蛋白质配合基；研究三维构型；研究酶的机制；手性设计；构像搜索，预测溶解度。
2. 反应与合成。预测热动力学和动力学；消除副反应；寻找过渡态；从X-射线结晶图显示结构；寻找催化路径。
3. 化学设计。使用Cache预测任何化合物的性质；研究三维构造；预测IR和UV-可见光谱；预测NMR和振动光谱；研究有机金属；构造和显示晶体；测量两个分子重合的RMS性质。
4. 多聚物。预测Tg，溶解度，内聚能，摩尔体积；预测热脱水。
5. 新增PM5哈密顿量，较AM1，PM3,和MNDO这些方法，在热构成计算上能提高四倍精度。
6. 最新版本支持所有的主族元素。
7. AM1-d方法支持过渡金属：Pt, Fe, Cu, Ag, Mo, V和Pd。
8. 全部计算都在图形界面中。CAChe 6.1增加：
1. 新的QSAR拓扑指数。
2. 自动绘制反应路径图。
3. Gaussian接口，在CAChe下运行Gaussian的任务（需要安装Gaussian）。
4. 自动2D-3D图批处理转化。
5. 用新的MM和MD参数，更精确地优化蛋白质和配合物的结构。
6. 输入和处理蛋白质晶体的结构。
7. LocalSCF内插模块，在半经验级别计算十万原子以上的蛋白质。
8. ProteinMD内插模块，用Amber 94/96力场进行分子动力学模拟。
9. ActiveSite内插模块，用于自动配体对接。
10.加载和净化蛋白质晶体结构的新工具。
11.新的QSAR描述符。
12.新的分析工具用于QSAR和QSPR。
13.用于简化配体设计和修改的工具。
14.自动排序（Needleman-Wunsch算法）。
15.把配体人工对接到蛋白质中。
16.半经验分子轨道程序MOS-F，用于预测闭壳层和开壳层分子的光谱特性。Scigress Explorer 7.7增加：
1. 与Windows VISTA兼容。
2. 执行Fujitsu MOPAC 2006计算引擎。Scigress Explorer停止开发。Scigress Explorer和Materials Explorer合并为Scigress项目。
SCIGRESS 1.0增加：
1. 通过反应过渡态和内禀反应坐标确定反应机理（MO-G）
2. 确定低能量构象（CONFLEX）
3. 显示振动的IR光谱和简正模式
4. 显示紫外-可见光谱, 识别电子跃迁涉及的分子轨道（ZINDO，MO-S）
5. 3D显示轨道，电子密度，和静电势能面（Huckel，MO-G，ZINDO）
6. 显示晶体和蛋白质的实验结构（Workspace，SequenceView）
7. 分子力学和动力学（Mechanics）
SCIGRESS 2.0增加：
1. 材料科学功能：创建聚合物、树状聚合物、界面、层面的模型；分子动力学引擎；全面的分子动力学分析
2. 化学数据库到CambridgeSoft ChemFinder的接口
3. 到最新版本MOPAC的接口
4. 最新版本CONFLEX
5. 到GAMESS的接口
SCIGRESS 2.1增加：
1. 允许用户定义MD-ME计算的化学元素
2. MD-ME静电势分布可以使用可变电荷势
3. 片段库加入ME Mol文件和ME的无穷链单位晶胞文件
4. 支持读入ME Mol文件和保存CSF文件
5. 图形显示偶极矩
6. MO-G支持PM6
SCIGRESS 2.4（欧洲版3.0）增加：
1. 图形用具界面全部重新设计
2. 分子动力学的势能参数优化，势能编辑器，EEM方法用于部分电荷计算
3. 改进了对接引擎
4. MO-G加入RM1
5. 简化的波函分析工具
SCIGRESS 2.4（欧洲版3.1）增加：
1. 执行量子半经验对接
2. 用LocalSCF生成构象
3. Linux桌面版
SCIGRESS 2.5（欧洲版3.1.4）增加：
1. 分子动力学计算加入新的势
2. MO-G估算pKa
3. MO-G优化MM矫正参数
4. 加快了CGDMS收敛和计算速度
5. 片段库可编辑
6. 支持CONFLEX7
7. 支持ADF2013
8. GAMESS接口的新功能：过渡态优化；振动光谱；势能面；内禀反应坐标
9. 支持MOPAC2012（欧洲版3.1.6）
SCIGRESS 2.6（欧洲版3.1.8）增加：
1. IR跃迁动画
2. 在平面上显示势能面的等高线图
3. MO-G升级源代码
4. 分子动力学计算加入新的势
5. GAMESS计算的部分电荷和紫外可见光谱
5. Gaussian计算的紫外可见光谱SCIGRESS 2.7（欧洲版3.2）增加：
1. 自动QSAR分析
2. LAMMPS接口
3. 透明操作云计算和格点计算系统
4. 蛋白质清洁功能
5. MacOSX支持GAMESS
6. 批处理SCIGRESS计算
7. Fastdock代码做了优化
8. DGauss计算NMR谱
9. 支持Windows 10SCIGRESS 2.8（欧洲版3.3）增加：
1. 图形界面下提交Quantum ESPRESSO任务和分析结果
2. 扩充LAMMPS结构优化和分子动力学功能
3. MO-S计算加入直接CIS，CM2和CM3电荷SCIGRESS 2.8.1增加：
1. 改进的MD-ME势选择向导
2. 准备对接的受体时，可以逐步准备对接的输入
3. Autodock Vina的接口
4. PDB数据时的蛋白质清理功能
5. 溶剂分子向导
6. 分析对接结果时的显示法
7. 立体图形分子的3D显示
8. MO-G和MM做模拟时，可以动画显示结构优化
9. 改进了MO-G，MM，MD-ME的能量和梯度的图形显示
10.DGauss模拟NMR谱
11.改进了快捷键，可以实时显示原子电荷
12.改进了自动QSAR功能
13.支持LAMMPS最小化
14.支持MOPAC2016
15.Autodock Vina的电子表格功能
16.增强了安装/卸载过程
17.改进了在线许可机制SCIGRESS 2.9（欧洲版3.4）增加：
1. 一般目的的量子化学程序包niedoida：HF，MP2，DFT，布居分析（Mulliken，Löwdin，Hirshfeld，Voronoi，Bader），键级分析（Nalewajski-Mrozek，Mayer，Gopinathan-Jug）
2. DFT，半经验，分子动力学并行化SCIGRESS 3.5增加：
1. MD-ME计算
2. MD-ME图的密度分布分析
3. 支持外部工具的UFF力场设置
4. Quantum ESPRESSO接口计算折射率和可变晶胞
5. 读入GAMESS的log文件时自动创建化学键
6. 在MD模拟动画中显示时间戳
7. mol2文件格式解析CRYSIN部分
8. 到Open Grid Scheduler的接口
9. 支持并行远程计算SCIGRESS 3.6增加：
1. 图形框架完全重写，以获得更好的性能
2. 自定义QSAR可以使用一组选定的描述符
3. MD电子表格，可以对一组样本用相同参数进行大规模计算，或者对同一样本同一参数的不同值进行大规模计算
4. DGauss计算极化率和偶极矩
5. 首次实现的Python脚本，可以执行本地或服务器上的SCIGRESS模块（MO-G、Quantum ESPRESSO、MD-ME）
6. 实验阶段的Python脚本，用于控制SCIGRESS的图形用户接口，进行MD-ME模拟和进行基本分析
7. 对选择的原子进行MD分析
8. 增强了密度分布分析功能，报告各个原子在分子中的分布
9. 通过GAMESS进行NMR计算
10.通过Quantum ESPRESSO进行Car-Parrinello分子动力学模拟
11.LAMMPS运行向导
12.通过*.gro格式输入Gromacs的模拟
13.在Quantum ESPRESSO中加入可变晶胞的支持
14.在轨迹窗口中可以仅显示晶胞的一部分
15.AutoQSAR描述符保存在文件中
16.指定MD轨线的颜色
17.人工指定图像视角的位置，并且可以复制到其它样本中
18.通过WSL支持Quantum ESPRESSO平台 Windows，Linux，MacOS。 相关软件