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1. 计算方法有：在MOPAC中有：AM1，AM1-d，PM3，MNDO，MNDO-d，MINDO/3；在MOS-F中有：CNDO/2，CNDO/S，CNDO/S2，CNDO/S3，INDO/S。适用原子：
MINDO/3（H，B，C，N，O，F，Si，P，S，Cl）；
MNDO (1977)（H，Li，Be，B，C，N，O，F，Na，Mg，Al，Si，P，S，Cl，K，Ca，Zn，Ga，Ge，As，Se，Br，Rb，Sr，Cd，In，Sn，Sb，Te，I，Cs，Ba，Hg，Tl，Pb，Bi，S，Cb）；
AM1（H，Li，Be，B，C，N，O，F，Na，Mg，Al，Si，P，S，Cl，K，Ca，V，Fe，Cu，Zn，Ga，Ge，As，Se，Br，Rb，Sr，Mo，Pd，Ag，Cd，In，Sn，Sb，Te，I，Cs，Ba，Pt，Hg，Tl，Pb，Bi，Si，S，Cb）；
PM3 (1985)（H，Li，Be，B，C，N，O，F，Na，Mg，Al，Si，P，S，Cl，K，Ca，Ti，Zn，Ga，Ge，As，Se，Br，Rb，Sr，Cd，In，Sn，Sb，Te，I，Cs，Ba，Hg，Tl，Pb，Bi，Cb）；
PM5（H，Li，Be，B，C，N，O，F，Na，Mg，Al，Si，P，S，Cl，K，Ca，Zn，Ga，Ge，As，Se，Br，Rb，Sr，Cd，In，Sn，Sb，Te，I，Cs，Ba，Hg，Tl，Pb，Bi）；
mndo_d（Na，Mg，Al，Si，P，S，Cl，Zn，Br，Cd，I，Hg）。
2. 可以进行的计算有：几何优化，过渡态结构，激发态结构，线性标度SCF计算(MOZYME方法)，反应坐标能量图，热构成（气相或溶液），简正模式振动分析，溶剂特性（气相，水，辛醇，等），IR光谱，原子电荷，极化率，偶极矩，分子轨道，电子密度，梯度范数，力，能量分配，ESP原子电荷，键序，参量化分子静电势，体系间交叉结构，氨基酸片断顺序的结构分析，IRC/DRC。
3. 支持的输入文件格式：MOPAC，MOS-F，Gaussian输入文件(*.gjf)，Gaussian fchk文件(*.fch)，Cartesian文件(*.car)，PDB。
4. XMO工具可以显示分子。MOS-F
1. 进行半经验分子轨道方法INDO/S，CNDO/S，CNDO/S2，CNDO/S3和CNDO/2等的计算。
2. 单电子激发组态相互作用(CIS)的光谱计算，支持单重激发态和三重激发态。CIS还能计算激发态的电子密度和电偶极矩。
3. 随机相位近似(RPA)的光谱计算。
4. 分子特性计算：含频率极化率，静态第一超极化率，电-光泡克尔效应，产生二次谐波，光学检波，静态第二超极化率，包含克尔效应的直流电场，包含二次谐波的直流电场，产生三次谐波，简并四波混频，包含光学检波的直流电场。
5. 用Onsager模型进行SCRF计算，预测溶液中的分子特性：CIS/RPA波函的电子光谱；用CIS波函预测激发态的电子密度和电偶极矩；用CIS波函计算含频率极化率，第一超极化率，和第二超极化率。
6. 解析的Pariser-Parr，Nishimoto-Mataga，Nishimoto-Mataga-Weiss，Ohno，Ohno-Klopman，和DasGupta-Huzinaga公式，用于求解双中心电子排斥积分。
7. 支持的坐标输入格式有Gaussian型Z矩阵和MOPAC内坐标。
8. 到WinMOPAC的输入/输出接口。
9. 对溶质，自动计算空穴半径；通过指定溶剂名称，自动设置介电常数和折射率。
10.改善SCF收敛的DIIS方法。
11.转动常数；惯量主轴和偶极矩的夹角。 MOPAC2002 V1.5和WinMOPAC 3.9的新功能：
1. MINDO，AM1，PM3，PM5新增加对13种过渡金属（Sc,Ti,V,Cr,Fe,Co,Ni,Cu,Zr,Mo,Pd,Ag,Pt）的支持。
2. MOS-F模块升级到6.0。可以用AM1，PM3，PM5计算电子光谱，支持更多的元素；考虑溶剂影响；计算极化率和超极化率；直接SCF方法；快速的直接四指数积分变换方法。
3. 线性标度COSMO方法，能够对大分子进行COSMO计算。 MOPAC2006 1.0新增功能：
MOS-F模块：ROHF + CIS计算开壳层分子激发态，QM/MM-CIS/RPA计算生物大分子的激发态，INDO/S新增对Li, F, Mg, Si, P, S, Zn的支持，LAPACK提高了矩阵对角化计算的速度。
MOPAC模块：单点、几何优化、振动频率和COSMO实现并行，周期边界条件。 |