HyperChem 主页 http://www.hypercubeusa.com/ 简介 图形界面,有半经验方法(扩展Huckel,CNDO,INDO,MINDO/3,MNDO,MNDO/d,AM1,RM1,PM3(支持过渡金属),ZINDO/1,和ZINDO/S),UHF,RHF,MP2,CI和密度泛函。可进行单点能,几何优化,分子轨道分析,预测可见-紫外光谱,蒙特卡罗和分子力学计算。主页同时提供试用版下载。 功能 1. 结构输入和对分子操作。
2. 显示分子。
3. 化学计算。用量子化学或经典势能曲面方法,进行单点、几何优化和过渡态寻找计算。可以进行的计算类型有:单点能,几何优化,计算振动频率得到简正模式,过渡态寻找,分子动力学模拟,Langevin动力学模拟,Metropolis蒙特卡罗模拟。支持的计算方法有:从头计算,半经验方法,分子力学,混合计算。
4. 可以用来研究的分子特性有:同位素的相对稳定性;生成热;活化能;原子电荷;HOMO-LUMO能量间隔;电离势;电子亲和能;偶极矩;电子能级;MP2电子相关能;CI激发态能量;过渡态结构和能量;非键相互作用能;UV-VIS吸收谱;IR吸收谱;同位素对振动的影响;对结构特性的碰撞影响;团簇的稳定性。
5. 支持用户定制的外部程序。
6. 其它模块:RAYTRACE模块,RMS Fit,SEQUENCE编辑器,晶体构造器;糖类构造器,构像搜寻,QSAR特性,脚本编辑器。
7. 新的力场方法:Amber 2,Amber 3,用于糖类的Amber,Amber 94,Amber 96。
8. ESR谱。
9. 电极化率。
10.二维和三维势能图。
11.蛋白质设计。
12.电场。
13.梯度的图形显示。HyperChem 7.0版新增功能:密度泛函理论(DFT)计算;NMR模拟;数据库;Charmm蛋白质模拟;半经验方法TNDO;磁场中分子计算;激发态几何优化;MP2相关结构优化;新的芳香环图;交互式参数控制;增强的聚合物构造功能;新增基组。
HyperChem 7.5版新增功能:OpenGL绘图,支持自定义色彩;增强的构建蛋白质模型功能,以及对蛋白质结构的操作;大分子的电子密度近似方法。
HyperChem 8.0版新增功能:
1. 兼容Microsoft Vista。
2. 第三方软件接口。执行GAMESS,PQS,MOPAC2007,WinGamess,PC-Gamess,Q-Chem,Gaussian,等的计算,产生输入文件,读取输出用于显示轨道、光谱等,接口是开源的,可以对其进行扩充,接到用户自己的代码中。
3. 批处理功能。
4. 所有数值都改为双精度。
5. Undo和Redo,Draw和Undraw选项;最近四个文件列表。
6. 结构测量功能;化学取代功能。
7. 熵和自由能;任意温度的热容;零点能;速率常数;平衡常数。
8. MP2增加了新功能,只要能做SCF的地方,就能研究后-Hartree-Fock结果。
9. CI从单点计算菜单中独立出来,使用更简单和方便。
10.温度作为全局变量,不仅仅用于分子动力学,蒙特卡罗,等。
11.计算光谱的线宽。
12.MM-QM更清晰地定义量子区和经典区。
13.MD计算中可以固定原子。
14.分子力学计算加入电场。
15.分子的3D显示。
16.对量子力学和分子力学计算进行振动分析。
17.箱中粒子,用于教学。
18.多种单位系统:kcal/mol,kJ/mol,a.u.。
19.新的半经验方法RM1。RM1方法是重新参数化的AM1,结果优于AM1和PM3,支持的元素有H,C,N,O,P,S,F,Cl,Br,和I。平台 Windows,MAC OS (7.52版以上),Linux(8.06版以上) 相关软件 1. ACES II 2. AmberFFC 3. AOMix 4. ArgusLab 5. Brabosphere 6. ChemCraft 7. COSMOS 8. gOpenMol 9. JMol 10. MOLDRAW 11. Molekel 12. RM1 13. SIG-JK 14. VMOdes