| 1. 图形用户界面: 构建有机、无机分子和聚合物模型,显示3D模型,从反应库自动产生过渡态,工作表用于分析和绘图,用等高图或轮廓图显示分子轨道、电子密度、自旋密度、静电势等。 2. 所有的计算方法都在图形界面下实现: 分子力学(SYBYL和MMFF94),半经验方法(MNDO,MNDO/d,AM1,以及PM3。其中PM3对部分过渡金属实现了参数化),Hartree-Fock,密度泛函理论(DFT,包括局域密度模型SVWN,梯度修正模型BP和BLYP,以及混合模型B3LYP......),局域化MP2(LMP2,结合赝势,可以比传统的MP2程序快1至2个数量级),全电子和赝势基组(全电子基组有3-21G,6-31G*,cc-pVTZ,以及加上了极化和弥散函数的扩展;赝势基组有LAV3P,LAVCP,LACV3P,以及加上了极化和弥散函数的扩展),SM5.4模型进行溶剂计算,其它(QSAR拓扑指数,振动频率,等)。 3. 能够进行的计算任务类型: 坐标驱动(模拟化学反应),分子排列(相似性和重叠分析,用于比较分子),构型搜索,计算能量(生成热和形变能),确定平衡结构和过渡态结构(几何优化过程中可以限制和固定原子),计算简正模式的振动频率,计算反应和活化能,扫面几何坐标,自动探测分子对称性。 4. 可以计算的分子特性: 电荷(Mulliken电荷,静电拟合电荷,NBO),轨道电荷(自然成键轨道电荷),Bader电荷,偶极矩,其它(焓,熵,自由能)。 |