Spartan 主页 http://www.wavefun.com/ 简介 图形界面的量子化学从头计算程序。 功能 1. 理论方法:从头Hartree-Fork,密度泛函(局域密度近似,以及BP,BLYP,EDF1,B3LYP),MPn(MP2,MP3,MP4,LMP2),更高级的相关能计算(CCSD,CCSD(T),OD,OD(T),G2,G3),半经验方法(MNDO,MNDO(d),AM1,PM3),蒙特卡罗和分子力学。
2. 计算类型:单点能计算,几何优化,组态分析,预测化学反应,平衡位置和过渡态寻找,水溶液的SM5.4能量计算,Mulliken和NBO的布居分析。
3. 全部计算和结果的显示都在图形界面下完成。Spartan'04的新功能:
1. 图形用户界面:从计算的IR数据绘制红外光谱图,从Hartree-Fock分子轨道理论绘制13C NMR图,Spartan分子数据库及搜索,显示氢键,产生和跟踪内反应坐标(IRC),输入和输出SDF,TGF,MOL各式的分子坐标文件,手性中心转置,用户控制动画速度,显示键型,在对话框中加入帮助功能。
2. 计算功能增强(部分功能来自Q-Chem):NMR谱(用Hartree-Fock模型计算化学位移,DFT模型正在开发),紫外/可见光谱(用Hartree-Fock + CIS,或者DFT + TDDFT模型计算垂直激发能),构象搜索,内反应坐标。Spartan'06新增功能:
1. 图形用户界面的新功能:
1) Substituent工具用于构造替代分子和虚拟数据库
2) 无缝访问ChemDraw,创建2D分子
3) 访问Chemical Function Descriptor
4) 从蛋白质文件PDB提取配合物和结合位置的环境
5) 从NIST在线数据库获取实验IR和UV/vis光谱
6) 从Cologne大学在线数据库获取实验NMR谱
7) 计算光谱和实验光谱间的换算
8) 从RCSB蛋白质数据库获取蛋白质和核酸
9) Spartan分子数据库增加到140,000个分子。可以检索名称,分子式,质量,异构体,等
10) 反应数据库,1500个以上子结构可检索的反应类型
11) 输入2D CDX文件和3D CIF文件
12. 自动倒置绝对组态(对应体变换)
2. 计算增强,算法由Wavefunction公司和Q-Chem公司合作开发:
1) 构象异构体数据库
2) 相似性分析
3) 新的RM1半经验方法,一种重新参数化的AM1
4) 使用双基组,使用微扰理论的精确基组外推
5) 高精度的热化学计算G3(MP2),精度达到3 kJ/mol。使用的分子体系达到400质量单位。
6) RI-MP2Spartan'08新增功能:
1. 溶剂化模型SM6和SS(V)PE连续模型。
2. RI-CIS(D)把CIS(D)能量计算的速度提高一个数量级,结构优化速度提高三倍。
3. 新的泛函。PBE,ωB97X-D,M05,M06,Slater-Dirac,Vokso-Wilk-Nusair,Perdew-Zunger,Wigner,Becke88,Gill96,Gilber-Gill99,Lee-Yang-Parr,Perdew86,GGA91,BMK,EDF1,和EDF2。用户可以定制交换-关联泛函。
4. 热化学。T1流程使得G3(MP2)的生成热精度达到2 kJ/mol (RMSD)。
5. NMR加上校正因子,绝对误差减小到2ppm以下。Spartan'10新增功能:
1. 基本设置:支持64位芯片,文件压缩,实时显示结构,定制图标
2. 图形用户界面:简化了常用的图形显示;多维势能面显示;公式编辑器;加入新的QSAR描述符
3. 计算:RI-CSD(D)梯度用于优化激发态结构;多核并行;PM6半经验参数;扩展了T1热化学方法
4. 图形模块:轨道能量图;切面;成键特性图
5. 谱学:NMR;在HF和DFT级别计算拉曼谱
6. 数据库:分子数据库加入了在B3LYP/6-31G*级别计算的5000种过渡金属无机物和有机金属化合物;光谱和特性数据库包括近50000种分子的IR、NMR、性质、QSAR描述符数据;数据挖掘;红外数据库Spartan'14新增功能:
1. 图形用户界面增加新功能:重绘的图标和工具栏,完全支持触摸器件,等。
2. 计算增强:HF和DFT级别计算Raman频率和强度;NMR化学位移校正方案;RI-CIS(D)梯度,可以计算激发态的平衡结构;HF和DFT振动频率实现并行化。
3. Windows和Linux版实现完全64位。Spartan'16新增功能:
1. 重新构造了密度泛函计算菜单,有大量的泛函供选择;通过关键词定制泛函或指定其它泛函
2. G3(MP2)elect,G3elect,G4(MP2)elect,G4elect,G4
3. 完全TDDFT用于激发态计算
4. 无缝流程计算柔性分子的NMR谱
5. B3LYP & ωB97X-D/6-31G* & 6-311G*级别NMR位移的第三代经验校正
6. 扩充了基组
7. 图形界面的增强
8. 数据库的增强Spartan'18新增功能:
1. 自动构象分析
2. 对柔性分子计算Boltzmann平均的NMR谱
3. DP4测量,获得实验和理论NMR化学位移的最佳匹配
4. 键耦合常数
5. 从3D结构获得2D草图
6. 最新的计算方法:GGA泛函B86PW91,BLYP,BPW91,B97-D2,SOGGA11,PBE-D3,VV10;GH-GGA泛函B3LYP,B3LYP-D3,EDF2,B3PW91,B97-3,MPW3LYP,SOGGA11-X;RSH-GGA泛函wB97X-D,wB97X-V,wB97X,CAM-B3LYP,N12-SX,LC-VV10;mGGA泛函B97M-V,M06-L,BMK,M11-L,TPSS-D3;GH-mGGA泛函M06-2X,M06,M08-HX,M08-SO,MPW1B95;RSH-mGGA泛函M11,wB97M-V,MN12-SX;新的有效芯势用于镧系元素体系的能量和优化
7. 远程提交任务和访问远程数据库
8. 图形接口的各种新功能。无缝连接到ChemDraw
9. 反应数据库SRD
10.增强了并行处理Spartan'24新增功能:
1. 进一步扩充了Spartan Spectra & Properties数据库(SSPD),同时支持单次提交计算的SSPD兼容性任务,用户可以对本地SSPD进行扩展,包含感兴趣的分子。
2. 首次结合用AI技术开发的计算模型,包括5个神经网络模型,越来越多的应用。
3. 通过神经网络改进分子力学MMFF的构象能计算
4. 通过神经网络估算DFT的分子结构
5. 改进Boltzmann加权的多构象能量计算
6. 通过神经网络提高DFT的能量精度
7. 机器学习模型用于多步构象搜索,比用纯量子化学计算快几个数量级平台 Windows, Linux, Unix, MacOS 相关软件 1. AmberFFC 2. AOMix 3. gOpenMol 4. JMol