TURBOMOLE 主页 https://www.turbomole.org/
https://www.3ds.com/products-services/biovia/products/molecular-modeling-simulation/solvation-chemistry/turbomoler/简介 Turbomole是德国卡尔斯鲁厄大学R. Ahlrichs教授领导的理论化学小组开发的一组量子化学计算程序。由COSMOlogic公司负责管理和销售。
Turbomole被认为是进行HF,DFT,MP2计算最快最稳定的代码之一。它的特色不是新方法和新功能,而在于解决如何用尽量短的时间和尽量少的内存需求,快速、稳定地处理工业应用型的分子。特别是它独有的RI-DFT方法,据称可以较其它大多数DFT程序节省10倍的CPU时间,因此非常适合于大分子计算或中等分子的重复性计算(如几何优化)。Turbomole目前支持串行和并行两种计算模式,可以运行于大多数主流UNIX平台上。可以下载DEMO版。功能 1. 基本算法和性能:
半直接算法可以调整主内存和硬盘空间需求;Fortran 90动态内存分配;用于数值积分稳定和准确的网格;内存和硬盘空间要求低;可以使用所有的点群;用RI技术对双电子积分做近似(用于MP2、DFT、CC2);使用线性标度算法降低内存需求。
2. 能量计算:
对于闭壳层和开壳层体系,可以进行的计算类型有:SCF(也就是Hartree-Fock),高效的RI技术用于MP2、CC2、DFT,此外还能进行从头分子动力学(AIMD)计算;使用多极加速RI-J近似的O(N)-RIDFT;COSMO程序对能量进行闭壳层和开壳层计算;CIS、CIS(D)、CC2、TDHF (RPA)或TDDFT计算电子激发能,可用于自旋非限制情况;CIS、TDHF和TDDFT的激发能计算可以用Block-Davidson算法;RI-TDDFT方法。
3. 能量梯度和能量二阶微分:
力场级别的全局力场(UFF)进行几何优化和解析笛卡尔Hessian计算;DFT级别的解析闭壳层Hessian计算;能量和梯度的闭壳层和开壳层计算;使用约化梯度的过渡态寻找算法;CPHF用于作用力的计算;COSMO程序对梯度进行闭壳层和开壳层计算;部分使用了RI近似的解析二阶导数计算;CIS、RPA和TDDFT进行激发态几何优化以及(数值的)力常数计算;RI-CC2对基态进行几何优化和力常数计算(使用数值的Hessian)。
4. 分子性质计算:
SCF、DFT或MP2级别的GIAO方法计算NMR;RI-CC2计算基态和激发态的单电子特性;CIS、RPA和TDDFT计算激发态特性;RI-TDDFT方法计算动态极化率和旋光色散。5.7版新增功能:
ECP支持到l-角动量。
改善了到d-函数的解析二阶导数计算。
二阶代数图表构造法ADC(2)的激发能。
显示基态、激发态的电子密度和微分密度。
在TDDFT中使用RI-J近似,用于激发态特性,几何优化,和(数值)力常数的计算。
用于多级加速RI-J (MARIJ)的解析梯度。
加入TPSS和TPSSH两种meta-GGA泛函(用于能量和梯度),包含RI-J。
辅助基函数优化的梯度,用于RI-MP2和RI-CC2计算。
4-zeta价电子质量的基组,用于原子H-Kr。
改善的过渡态优化;增加了新的基态几何优化程序。
自旋非限制的精确交换方法,用于LHF近似。
更容易阅读的使用手册电子文档。5.8版新增功能:
1. 对从H到Rn的元素(除镧系外)加入新的基组,对周期表的元素有一致的精度;
2. 加入5p和6p元素的小核ECP及相应的基组;
3. ECP程序支持g-投影(仅用于能量和梯度);
4. 并行多极加速RI-J方法(MARI-J);
5. 更快的积分程序,特别用于RI处理;
6. 对分子特性、波函分析工具和到图形工具的接口程序改善了功能,并简化了操作;
7. RI-CC2的激发态解析梯度;
8. 对RI-MP2和RI-CC2基态能量,以及RI-CIS(D),RI-CC2和RI-ADC(2)激发态能量实现并行化;
9. 输入模块的定义完全支持ricc2程序;
10.对使用QZVPP (H-Kr)和cc-pwCVXZ (B-Ne, Al-Ar)轨道基组的RI-MP2/RI-CC2计算加入了辅助基组;
11.COSMO包括对称性和更稳定的A-矩阵设置;
12.分子动力学中加入键长限制以及凝聚相中的虚空穴;
13.友好的新输入生成程序TMOLE,具有多种功能(如Z-矩阵输入,势能曲线计算,等);
14.新的DIIS方法和阻尼,默认用于加速SCF收敛;
15.当最小化和过渡态优化失败时,自动在内坐标和直角坐标间切换;
16.最大原子数目和基函数数目分别增加到700和10000。5.9版新增功能:
1. 方法:
a.RI-J用于Hartree-Fock和DFT杂化泛函,提高效率;
b.RI-JK梯度和DFT杂化泛函计算的增强
c.aoforce模块增强,可进行一直到g函数基组和一直到g投影的ECP的解析谐振频率计算;
d.RI-CC2/RI-MP2:对基态和激发态的梯度并行化,以及激发态ADC(2)和CIS(D_infinity)的梯度;
e.MD:使用Nose-Hoover温度控制的有限温度正则Born-Oppenheimer分子动力学;
f.NPA:Weinhold的自然布居分析;
g.新的自动优化方法用于最低点和过渡结构;改善了内冗余坐标的总稳定性及生成;
h.RI-MP2-R12:闭壳层和开壳层体系的单点显式关联RI-MP2-R12能量;
i.BSSE:完全函数平衡方法执行结构优化,可避免基组重叠误差。
2. 效率:
a.RI-J结合Hartee-Fock交换,使得大型Hartree-Fock或DFT杂化泛函的计算加速;
b.MARI-J (多极加速RI-J):在减少总计算量的前提下提高了精度;
c.更好的并行加速度;
d.aoforce模块:提高了效率。
3. 基组和辅助基组:
a.镧系和锕系直到Lr的基组;
b.RI-J辅助基组(jbasen)用于def2-基组(H-Rn)以及def-基组(镧系和锕系);
c.RI-JK辅助基组(jkbasen)用于所有的三、四zeta价电子基组,包括镧系和锕系;
d.用于RI-MP2和RI-CC2的新辅助基组(cbasen),包括:def2-QZVPP用于Rb-Rn(不包括镧系);def2-SVP,def2-TZVP,和def2-TZVPP用于H-Rn(不包括镧系);(aug-)cc-pVXZ-PP和(aug-)cc-pwCVXZ-PP,其中X=D,T,Q,5,用于Cu,Ag,Au和Zn,Cd,Hg;
e.一直到l函数的辅助基组。
4. DFT求积分:
a.新的格点用于镧系和锕系直到Lr;
b.格点优化:DFT不再有“未优化格点”;
c.DFT格点扩展到弥散情况;
d.修改了积分的数值问题。TURBOMOLE 5.9.1的新功能:
1. Linux/PC和Itanium2/Linux并行版使用HP-MPI。
2. statpt可以固定笛卡尔坐标;更稳定的内坐标。
3. Windows版的Turbomole。
4. 新的图形用户界面TmoleX。TURBOMOLE 5.10的新功能:
1. 振动拉曼强度:含频TDHF和(杂化)TDDFT极化率的解析二阶导。
2. 自旋轨道耦合:用自旋轨道ECP的二分量RI-Hartree-Fock和RI-DFT计算。
3. SCS-RI-MP2:闭壳层HF和UHF参考态、并行和串行执行的能量及梯度。
4. 周期点电荷:用于HF和DFT的能量和梯度计算。
5. DFT+D:包含色散的DFT。
6. COSMO用于RI-MP2计算。
7. 特性:Merz-Kollman ESP拟合。
8. 自旋反转用于破缺对称性的处理。
9. 改善了效率:基于RI-HF的RI-MP2/RI-CC2梯度和特性;NumForce可以操作冻结笛卡尔坐标;NumForce和jobex可以把RI-JK和RI-MP2/RI-CC2一起使用。
10.工具:用二进制格式保存分子轨道文件;tm2molden支持g函数;3D格点文件使用cube格式;把振动频率输出转化到G98格式。TURBOMOLE 6.0的新功能:
1. 功能:SCS-CC2计算基态和激发态的能量,梯度,跃迁矩及一阶特性;解析二阶导数支持meta-GGA泛函(TPSS,TPSSh)) ;MP2-F12;点电荷的梯度用于QM/MM;MP2-COSMO梯度;流程图管理脚本MoleControl;DFT积分使用不同的密度。
2. 效率:DFT基态能量计算用密度差加速;默认优化程序从relax改为statpt;临界点计算和固定优化坐标更稳定;改善了解析二阶导计算的效率;ADC(2)级别的并行梯度和响应特性已经完全工作。
3. 工具:MoleControl用Python脚本控制任务;分析二分量相对论波函;vibration脚本产生gnupolt输入文件,显示IR振动光谱;输出轨道到AOMix程序;对post-SCF热力学特性使用换算的等密度空穴进行COSMO计算;简化COSMO的安装;简化了特性和波函分析;基组库添加了更多基组;改变了并行版本的默认设置。TURBOMOLE 6.1的新功能:
1. 功能:N4自旋标度SOS-RI-MP2;更快的MP2-F12;CC2激发态之间的单电子跃迁距;C1点群的Douglas-Kroll-Hess能量;并行的增强。
2. 效率:对于AMD CPU,速度提高了30%;提高了并行版的速度;MPI版减少了主节点的CPU使用。TURBOMOLE 6.2的新功能:
1. 功能:首次执行CCSD,CCSD(F12)各种变体,以及CCSD(T)(ricc2模块)。
2. 效率:用OpenMP并行执行LHF(dscf模块)。
3. 使用:TmoleX 3.0:加入预优化工具MOPAC7,显示光谱,PES扫描的新方法,支持TURBOMOLE的更多功能;LHF支持到h函数和使用ECP的重元素;在用户定制的格点上绘制交换关联势图;MoleControl 2.1版。TURBOMOLE 6.3的新功能:
1. 并行SMP版支持二阶解析导数,TDDFT激发能和梯度,CCSD和CCSD(T)
2. CCSD和CCSD(T)使用D2h对称性及其子群
3. 振动频率计算可以续算
4. TDDFT垂直激发能可以使用COSMO溶剂模型
5. 高效的CCSD(F12*)方法
6. 二分量MP2-F12用于自旋轨道耦合能量计算
7. Karlsruhe基组加入了对特性优化的弥散函数:def2-SVPD,def2-TZVPD,def2-QZVPD
8. 新的分块收缩基组,用于标量和二分量Dirac-Fock有效芯势
9. 支持DFT-D3色散矫正,包括二阶导数TURBOMOLE 6.4的新功能:
1. DFT/TDDFT:◦RI-RPA;非绝热TDDFT表面跳跃;自旋反转TDDFT;标量和二分量计算使用半数值HF交换;二分量DFT能量的梯度;冻结密度嵌入(FDE)。
2. post-HF:SOS-CC2激发能的O(N4)标度TURBOMOLE 6.5的新功能:
1. CCSD垂直激发能
2. MP2和CC2的极化率
3. MP3(F12)和MP4(F12)能量
4. 新的odft模块,用于计算所有的含轨道Kohn-Sham DFT方法,包括LHF和仅有交换的优化有效势(OEP-EXX)TURBOMOLE 6.6的新功能:
1. RI-RPA梯度
2. 二分量TD-DFT考虑旋轨耦合(escf)
3. ADC(2)激发态通过COSMO考虑溶剂化效应(ricc2)
4. 反应路径优化(新模块woelfling)
5. 反应路径优化从线性同步转变(LST)开始,之后是态链方法
6. M06和M06-2X泛函(ridft,rdgrad,dscf,grad,aoforce,escf)
7. 基于色散校正的VV10类泛函(ridft,rdgrad)
8. GW近似下的多体微扰理论(escf)
9. 一阶电子振动耦合(新模块evib)
10.二分量RI-RPA能量(rirpa)
11.CCSD(T)能量使用MP2-F12干扰校正(ricc2)
12.ricc2加入MP2/COSMO;删除rimp2模块
13.加入社区版IBM平台MPI,Turbomole计算无需再安装MPI
14.镧系def2基组TURBOMOLE 7.0的新功能:
1. 计算周期体系的DFT模块riper:riper模块在RI-DFT级别计算分子和周期体系的基态能量。
2. 低标度MP2和MP2-F12模块pnoccsd:pnoccsd包含基于电子对自然轨道的关联方法(OSV-PNO杂化近似),对大体系可以实现低标度。目前仅限于MP2。
3. 二分量的CCS,ADC(2),CIS(inf),和CC2激发能,以及ADC(2)和CC2的激发态跃迁矩。
4. 通过XCFun库实现几种自定义和预定义的密度泛函。
5. RI-RPA实现OpenMP并行化
6. 交互式特性程序proper,用于单电子密度的一阶性质(期待值),布居分析,以及产生用于显示的接口文件。
7. 能量分解分析(EDA)。
8. Grimme的PBEh-3c泛函,包括DFT-D3和gCP。
9. TmoleX 4.1:二分量ECP,激发态势能扫描,重新设计的Orbital/Density PlotTURBOMOLE 7.1的新功能:
1. 新功能:DFT计算周期体系(用梯度做结构优化,ECP计算能量和梯度,DFT-D3色散校正的能量和梯度,金属的分数占据和smearing,显示能带图和DOS);非限制计算的RI-RPA梯度;全局结构优化的一般算法;COSMO等幅射线解析梯度。
2. 效率:TDDFT的快速Davidson算法;在(TD)HF和杂化(TD)DFT响应计算中,非正交Krylov空间方法与RI方法组合产生2至5倍加速;二阶解析导数的OpenMP/MPI并行;周期边界条件RI-DFT加入pob-TZVP基组。
3. 新的脚本和工具:MD后期处理工具用于内坐标和转动常数;tm2ezspec创建ezspectrum输入计算Franck-Condon因子;panama产生用于显示escf非松弛差密度的输入;内禀键轨道(IBO)分析。
4. TmoleX 4.2:支持周期边界条件RI-DFT计算;显示能带结构。TURBOMOLE 7.2的新功能:
1. 新功能:VCD谱(Hartree-Fock和DFT);用COSMO做振动频率计算;周期边界条件(优化单位晶胞,绘制DOS,绘制晶体轨道,改进了OpenMP并行,在内存中存储RI积分);Bethe-Salpeter激发能;CC2级别的双光子跃迁矩;局域杂化泛函;(SOC-PT-)CC2计算磷光寿命;AIM临界点;Fukui函数;PBE和PBE0泛函计算NMR化学屏蔽;新的泛函B97-3c和SCAN;自旋非限制TDDFT计算非绝热分子动力学。
2. 效率:新的更稳定的TDDFT求解程序;更快更稳定的RI-RPA;(ridft/rdgrad)删除了GlobalArray库,MPI任务使用新的共享内存执行;(dscf,grad,aoforce,ricc2,pnoccsd)新的OpenMP/MPI杂化并行;完全64位数据模式。
3. 使用:并行版简化了输出;完全64位数据模式导致在事实上对于分子尺寸和内存大小没有限制。
4. TmoleX 4.3:显示AIM临界点;项目管理中改变任务顺序,以及在不同项目中移动任务;更好地支持周期边界条件计算;创建程序使用立体化学描述和进行修改;态密度;新的任务模板编辑器;SMILES支持;更容易地交互式生成布居性质(Mulliken,NBO,Loewdin,Wiberg,Paboon);改进了组合库工具。TURBOMOLE 7.2.1的新功能:
1. 新的X2C基组系列
2. MPI版XCFun各种泛函TURBOMOLE 7.3的新功能:
1. 闭壳层体系的PNO-CCSD(T0)和PNO-CCSD(T)能量
2. 新的DFT-D4色散矫正
3. 新型NMR(结合RI-J,COSMO,meta-GGAs,低标度HF交换,SMP并行化)
4. VCD光谱使用COSMO
5. 周期DFT使用更大基组(线性依赖的处理)
6. TDDFT/TDHF计算双光子吸收交叉部分,以及解析计算含频超极化率
7. 标量和二分量DFT的X2C梯度,支持完全X2C及DLU-X2C
8. 振动吸收/发射谱
9. CC2垂直激发能支持COSMO
10.TDDFT的NTO(自然跃迁轨道)
11.基于dRPA的RI-GW(非常快速的GW和BSE)TURBOMOLE 7.4的新功能:
1. NMR:HF和DFT级别的核耦合常数(费米接触项);标量DLU-X2C级别的全电子相对论NMR屏蔽常数;用于NMR屏蔽常数计算的误差一致分块收缩相对论全电子基组
2. DFT:LibXC库;范围分离DFT泛函(基态能量和梯度,NMR,TDDFT UV/Vis和CD谱)
3. 半经验:Grimme的xTB(紧束缚、GFN1、GFN2),能量和梯度
4. TDDFT,GW和BSE:二分量BSE和cBSE;二分量TDDFT使用杂化泛函;GW使用轮廓形变
5. RPA:RPA之上的快速微扰校正(AXK,ACSOSEX,裸二阶交换)使用RI近似
6. 一般:非相对论计算使用有限核模型;f区元素def2型辅助基组Cbas
7. 效率:几乎所有模块的OMP并行;escf和aoforce的半数值近似;egrad和aoforce的RI-K近似;改进了X2C能量和梯度的效率、内存需求、对称性使用;扩展了DFT格点用于相对论全电子计算;COSMO梯度的积分更快
8. 工具:使用Intel MPI 2019;TmoleX 4.5支持RI-RPA、半经验(MOPAC)和紧束缚(xTB),超极化率,可扩展可定制的泛函列表,重新设计的任务终止功能,结果合并功能进行了扩充TURBOMOLE 7.5的新功能:
1. 普通DFT:所有模块支持范围分离杂化泛函;非局域关联泛函VV10;LibXC升级到5.0.0
2. 周期边界条件DFT:杂化泛函的能量(包括范围分离的CAM-B3LYP和HSE)
3. 耦合簇(PNO,BCCD):接近线性标度的电子对自然轨道耦合簇方法(PNO-CCSD(T))计算闭壳层和开壳层体系能量;显关联Brueckner耦合簇方法(BCCD(T)-F12)计算闭壳层和开壳层体系能量
4. TDDFT,GW,Bethe-Salpeter:标量和二分量TDDFT、GW-BSE计算中使用阻尼响应;Meta-GGA用于TDDFT梯度计算
5. RPA:广义Kohn-Sham半正则投影的随机相位近似(RPA)计算总能量
6. NMR(屏蔽与自旋—自旋耦合):在HF、DFT级别计算核的自旋—自旋耦合常数;局域杂化泛函计算NMR化学屏蔽
7. 相对论方法及性质:二分量极化率(对DKH、BSS、X2C及其DLU近似包含图景变换校正);外电场中的二分量单点能计算(对DKH、BSS、X2C及其DLU近似包含图景变换校正,尚不能用于性质);标量相对论X2C基组;Meta-GGA泛函用于二分量计算
8. DFT局域杂化:二分量局域杂化RI-DFT能量;二分量局域杂化TDDFT激发能和UV/Vis光谱;局域杂化泛函计算TDDFT梯度;局域杂化泛函计算NMR化学屏蔽
9. CD谱:规范不变圆二色(ECD)谱
10.新方法:Hartree-Fock级别(用或不用RI-JK)的有限磁场;扩展的Roothaan-Hall方法用于HF、DFT求解程序
11.新模块:颜色预测工具用于计算或测量的光谱Turbomole 7.5.1的新功能:
1. 新的DFT泛函r2-SCAN,r2-SCAN-3c,以及用于r2-SCAN和r2-SCAN-3c的DFT-D4色散校正
2. def2-mTZVPP基组用于r2-SCAN-3c
3. 局域杂化泛函LH20-t
4. 4-ζ价电子质量的分块收缩误差一致基组用于标量和二分量全电子相对论计算Turbomole 7.6的新功能:
1. 加入Johnson的局域杂化泛函和改进的PSTS泛函
2. 分子计算的实时TDDFT(RT-TDDFT)
3. 二分量算法的DFT,MP2,CC2计算有限磁场,Hartree-Fock的解析导数,以及激发态计算(TDHF,TDDFT,GW/BSE,CC2)
4. 用GIMIC接口计算磁性
5. GIMIC用X2C/DLU-X2C哈密顿计算环电流
6. 流密度为动能密度做了推广,用于NMR位移,NMR耦合常数,SCF不稳定性
7. 用局域杂化计算NMR屏蔽的密度二阶导数,支持LH20t和LH14t-calPBE
8. 格林函数方法GW使用局域杂化泛函
9. 相对论BSS/DKH/X2C的图景变换校正,包括DLU方案
10.去冗余伪谱的semiJK算法用于标量和二分量计算
11.Libxc升级到5.1.4版
12.新模块mkspec用于电子吸收谱、圆二色谱、振动吸收、Raman光谱的经验展宽
13.用于一阶电子-振动耦合的evib包含了轨道能量关于原子坐标的一阶导数,可用于HF和杂化泛函
14.正则正交化可排除基组和辅助基组的近简并
15.CD-G0W0默认使用线性化
16.TmoleX支持新的任务类型:半数值交换;氧化/还原电位;计算动态/内禀反应坐标(DRC/IRC);颜色预测工具;电子亲和能与电离能;直接COSMO-RSTurbomole 7.7的新功能:
1. 在微扰级别和X2C变分级别的旋轨耦合方法计算EPR g-张量
2. 二分量X2C的NMR自旋-自旋耦合常数
3. 用Bethe-Salpeter方程和GW方法计算NMR自旋-自旋耦合常数
4. 非相对论、标量X2C、标量X2C+旋轨耦合微扰、二分量X2C计算超精细耦合常数
5. 非相对论、标量X2C、标量X2C+旋轨耦合微扰计算开壳层顺磁NMR屏蔽常数
6. 磁场中的LDA、GGA,通过TD-DFT计算磁场中的激发态
7. 采用芯价分离(CVS)近似,在CC2和ADC(2)级别计算芯激发
8. 复极化传播子(CPP)方法,在频率格点上计算CC2单光子吸收和ECD谱,不需做对角化
9. GKS-spRPA泛函计算单粒子能量(电离或亲和)
10.类似于紧束缚TDDFT的快速TDDFT-as方法
11.新的局域杂化泛函TMHF和TMHF-3P
12.用meta-GGA和局域杂化泛函计算NMR屏蔽常数、顺磁NMR轨道部分、EPR g-张量的流密度响应
13.计算旋轨耦合的流密度泛函框架:能量,梯度,激发能,NMR性质,EPR性质
14.基于能量的等离子性指数
15.T矩阵的VCD和IR极化率
16.范围分离的局域杂化泛函用于能量、基态梯度、TDDFT激发能,支持用户自定泛函输入
17.在等高线形变GW近似中使用频率取样技术,计算多个低位准粒子能量
18.多极加速单位分解方法用于escf和egrad
19.ricc2的roothome选项用于收敛到较高的根
20.广义二分量局域杂化计算
21.对所有的相对论(DKH,BSS,X2C,DLU)期待值进行图景变换校正
22.用相对论哈密顿(DKH,BSS,X2C,DLU)计算核电场梯度以及核四极相互作用张量
23.磁场中的含流metaGGA泛函
24.加入新基组;针对性质计算优化的基组(def2-SVPD,TZVP(P)D,QZVP(P)D)推广到镧系;Jensen的pcH,pcX,ccJ;IGLO-II和IGLO-III;用于NMR耦合计算的非收缩x2c-型基组;均匀调节参考基组
25.Libxc 5.2.3版的新泛函;r2SCAN杂化泛函(r2SCANh,r2SCAN0,r2SCAN50)使用色散校正;用户自定义泛函;所有泛函均可组合;泛函可以用名称的编号指定
26.NVidia GPU/Linux支持某些DFT二阶导数性质,GW和BSE平台 UNIX/Linux,MacOS,Windows。从7.1版起不再支持32位系统。 相关软件 1. Akira 2. AOMix 3. ASE 4. Brabosphere 5. ChemShell 6. DGrid 7. DIESEL 8. gOpenMol 9. Grimme-Waletzke RIMR 10. GRRM 11. MAPS 12. MCM95 13. MOLDRAW 14. Molekel 15. MolSOC 16. MOMAP 17. MonaLisa 18. SNF 19. SpecDis 20. TheoDORE 21. Vibrate 22. Viewmol 23. wxDragon 24. ZHTools