MOE
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简介　
　图形界面的分子操作环境。可用于药物开发，分子结构设计，蛋白质模拟和生物信息学，化学信息学和QSAR，药物化学应用，高产量研究，分子模拟，和方法的开发。
功能　
　理论化学方面的功能有：
1. 创建分子模型，输入/输出分子数据。
2. 分子力学和动力学。MOE包含了集成的、多处理器的、公开参数的力场引擎。力场参数包括AMBER 89/94/99，CHARMM 22/27，MMFF94(s)，OPLS-AA，和Engh-Huber模型。提供三种大标度能量最小化算法，并可以对键长、键角和扭转角施加束缚。MOE支持自动NVE，NVT，NPT，和NPH分子动力学模拟，并且可以加入原子墙限制。
3. 包含溶剂的静电影响。
4. 构象分析。
5. 灵活的小分子定位。
6. 衍射模拟，预测在气相、非晶液相、粉末或单晶相下，X射线、中子、电子衍射实验的结果。
7. 量子力学计算。MOE提供到从头计算、半经验和密度泛函代码的接口，包括GAMESS，Gaussian，ADF，MOPAC，和MOPAC 2007。通过使用图形接口设定计算和显示结果，如电子密度等高线，分子轨道图，能级图，以及其它特性。用MOE/smp可以对一组化合物的计算进行管理。
平台Windows，MacOS X，Linux，HP-UX，Sun Solaris，Silicon Graphics Irix。
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