VMD
主页http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
获取方法注册后下载。
简介 
 VMD是分子可视化程序,使用OpenGL提供高质量的3D分子图形。用于显示、动画演示和分析大的生物分子体系。
功能 
 原子、分子、残基的数量,以及动画画面的数量,在内存允许的范围内没有任何限制。
多种分子显示方式和着色方法。
立体显示功能。
包含了
Babel程序,用于格式转化。支持的格式参见使用手册和Babel
Tcl语言编写的图形和字符用户界面,用户可以自己编写自程序用于分子的分析。
用户可以用C++编写模块。
整合了
NAMD程序,与VMD一起快速稳定地进行分子动力学并行计算,并显示计算结果。
录制轨迹。
平台Mac OS,Unix,Linux,Windows。
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