| RasMol |
| 主页 | https://www.rasmol.net/ https://github.com/zhou0/RasMol |
| 获取方法 | 直接下载。 |
| 简介 | |
| | RasMol是分子图形程序,用于蛋白质、核酸和小分子的可视化,旨在用于显示、教学以及生成具有出版质量的图像。它以多种表示形式交互式显示分子,例如线框、棍状和空间填充球体;它支持大量文件格式,包括PDB和CIF;允许对着色和观看角度进行精确控制;等等。无论您是分析蛋白质-配体相互作用的研究人员,还是正在学习分子结构的学生,RasMol都能提供探索微观世界所需的速度和灵活性。 RasMol最初由Roger Sayle开发,现已成为结构生物学领域的标准工具。OpenRasMol项目作为RasMol开发的长期官方代码库,自2012年以来基本处于不活跃状态。当前项目旨在对代码库进行现代化改造,确保RasMol在未来继续满足科学界的需求。 |
| 功能 | |
| | - 广泛的格式支持:可读取PDB、Alchemy、Sybyl Mol2、MDL Mol、XYZ、CHARMm、MOPAC及(mm)CIF格式。
- 交互式可视化:通过鼠标、命令行或旋钮实现实时旋转、平移和缩放。
- 多种表示模式:线框、棍状、空间填充(CPK)球体、条带(实心或链状)、α-碳轨迹及点状表面。
- 高级着色方案:可按原子类型、残基、温度因子或二级结构着色。
- 阴影与切片:支持阴影效果的高质量渲染,以及交互式Z轴剪裁(切片)。
- 脚本功能:可加载脚本以恢复视角,或将当前状态导出为脚本文件。
- 导出选项:可将图像保存为PostScript、GIF、PPM、BMP、PICT、Sun光栅文件,或作为MolScript/Kinemage输入文件。
- 教学工具:广泛用于教学中,以展示分子对称性、成键和结构。
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| 平台 | Linux/MacOS/Windows |
| 相关软件 | |