| SZYBKI |
| 主页 | http://www.eyesopen.com/products/applications/szybki.html |
| 简介 | |
| | 化学分子结构和蛋白质结构优化工具。SZYBKI用Merck Molecular力场优化分子结构，可以考虑溶剂的影响，产生高质量的3D分子结构用于其它程序的输入。SZYBKI还可以修饰蛋白质结构的局部，优化蛋白质活性位内的配体，可以结合对接程序使用。 |
| 功能 | |
| | 1. MMFF94和MMFF94s的能量和优化结构。
2. ZAP的Poisson-Boltzmann模型或Sheffield模型考虑溶剂化影响，用于结合能和结构优化。
3. 蛋白质活性位极性氢或侧链的柔韧性。
4. 蛋白质活性位场内的配位场优化
5. 几种坐标框架（xyz，扭转，等）内的梯度最小化。
6. 每秒完全优化200个药物尺寸的气相分子。
7. 在确定能量和梯度时，可以选择去掉势中的各种项。
8. 束缚坐标。
9. 用OEChem产生全部I/O和分子信息。
10.读写SDF，MOL，MOL2，PDB，MacroModel，XYZ，OEBinary等文件格式。
11.通过PVM，对大多数Unix平台支持并行。 |
| 平台 | UNIX/LINUX，Windows，MacOS X |
| 相关软件 | |