PyMol 主页 http://www.pymol.org/
https://github.com/schrodinger/pymol-open-source （开源项目）简介 PyMOL是Python解释语言程序，用于分子图形实时显示，快速产生高清晰度的分子图像和动画。PyMol如今是Shordinger Suite的一部分。 功能 1. 优化的实时3D结构显示。
2. 八种不同的分子模型显示方式。
3. 读入标准的PDB，Macromodel，SDF，MOL，ChemPy格式文件。
4. 读入X-PLOR和CCP4图文件，用于产生电子密度等势面图。
5. 合并和拆分分子。
6. 输出PDB，Macromodel，ChemPy格式的文件。
7. 实时操作控制。
8. 距离测量，任意加入标签。
9. 裁减前后平面。
10.鼠标控制模型的显示和操作。
11.分子编辑工具。
12.晶体学对称性，以及显示单元晶胞。
13.球和表面的透明处理。
14.显示选择原子的电子密度。
15.分子重叠拟合。
16.OpenGL硬件加速。
17.不需要GUI的批处理工作模式。平台 Linux/Unix，Windows，Mac OS。 相关软件