Discovery Studio 主页 https://www.3ds.com/products/biovia/discovery-studio 简介 Discovery Studio是一套计算化学家和计算生物学家的生命科学分子设计解决方案软件包。Discovery Studio让检测大分子和小分子特性、研究体系、确定线索和优化候选分子更加容易。此外,Discovery Studio建立于Accelrys企业平台并使用管道导航技术,让科学家可以自动迅速完成例行任务,整合第三方应用程序,甚至部署模型。 功能 1. 2D和3D显示
2. 基于结构和结构导向的设计、对接、打分
3. 跨膜蛋白模拟
4. 2D和3D分子描述符
5. 虚拟筛选和化合物排名/打分
6. 同源建模
7. QM/MM
8. 受体-配体相互作用分析
9. 抗体建模
10.SAR分析,2D和3D QSAR
11.基于片段的设计
12.静电计算,蛋白质电离,pK预测
13.Bayesian统计,神经网络,递归分割
14.de novo设计
15.蛋白质建模和分析,蛋白质工程Discovery Studio 4.0新增功能:
1. 模拟科学:更快更强大地支持纳米标度分子动力学模拟;改善了模拟的工作流程;更快更强大的显式溶剂创建程序;增强的分子动力学分析工具
2. 生物研究:二硫键预测(新);同时进行多个突变(新);抗体库(升级);抗体模拟工作流程(升级)
3. 小分子药物研究:非键相互作用监测(新);原位FBDD先导化合物的优化(升级);原位FBDD core-hopping工具(升级);用MMPs查找活性Cliff(升级)
4. 合作伙伴科学:CHARMm c37b2(完全整合了对charmm36的支持);NAMD v9.2(现在已经包含了NAMD);MODELER 9v12;DMol3 version 6.1 SP2;VAMP version 10.0;支持CCDC的GOLD(升级)
5. 核心/平台:改善了客户端内存管理;支持最新的Accelrys Enterprise Platform v9.1平台 Windows,Linux 相关软件 1. CHARMm